1232. 자연도
1653. 영종진
1914. 04. 01 부천군
1973. 07. 01 옹진군
1989. 01. 01 인천직할시 중구 편입
1995. 01. 01 인천광역시 중구 영종동으로 개칭
2012. 01. 01 운서동 분동
2018. 01. 01 영종1동 분동
2026. 07. 01 인천광역시 영종구 출범

영종동(행정동)은 옛날에는 자연도라고 불렀다.
이는 송나라 서긍이라는 대신이 영종도 경원정에 들렀을 때 푸른 하늘에 제비들이 떼지어 나는 모습을 보고 제비가 많은 섬이라 하여 자연도(紫燕島)라고 이름이 지어졌다고 하며 영종도로 불리게 된 것은 조선시대 경기도 화성에 있던 영종진(永宗鎭)을 이곳으로 옮겨오면서부터라고 한다.
섬 주위의 용유도, 삼목도, 무의도는 모두 영종도와 수시로 오갈 수 있는 동일생활권이었으며, 국가가 운영하는 말 목장 등을 설치했던 해상방위의 요충지이기도 했다.
제비는 봄이면 남쪽에서 날아와 겨울에 따뜻한 강남으로 날아가는 날렵한 새로서 그 모습이 오늘날 인천국제공항에서 이륙하는 비행기의 모습과 흡사하여 옛부터 영종은 지리적으로 타고난 운명이라 할 수 있다.
현재 영종동은 3개의 법정동(중산동, 운남동, 운북동)으로 유인도 2개, 무인도 5개의 섬으로 구성되어 있다.